（一）近交系（Inbred strain）

1．定义 经至少连续20代的全同胞兄妹交配培育而成，品系内所有个体都可追溯到一对共同祖先。经连续20代以上亲代与子代交配与全同胞兄妹交配有等同效果。近交系以兄妹交配方式维持。近交系的近交系数（Inbreeding coefficient）应大于99%。

2．命名 近交系一般以大写英文字母命名，亦可以用大写英文字母加阿拉伯数字命名，符号应尽量简短，如A系、TA1系等。近交过程中有共同祖先但分离为不同的近交系，用相近的名称，如NZB、NZC、NZO等。有些品系没有按照这个规则进行命名，如129P1/J、615等。为了方便，近交系常用缩写表示。

3．近交代数 近交系的近交代数用大写英文字母F表示。例如，当一个近交系的近交代数为87代时，写成（F87）。如果对以前的代数不清楚，仅知道近期的近交代数为25，可以表示为（F？+25）。

4．亚系（Substrain）

（1）亚系的形成　近交系的亚系分化是指一个近交系内各个分支的动物之间，随着时间的推移和环境变化，出现遗传差异。通常下述三种情况会发生亚系分化。

1）兄妹交配代数在20代以后40代以前形成的分支，由于杂合残留导致遗传分化。

2）从共同祖先分开20代以上，因突然变异和遗传漂变（Genetic drift）导致品系内遗传分化。

3）经遗传分析已发现一个分支与其他分支存在遗传差异。产生这种差异的原因可能是残留杂合、突变或遗传污染（Genetic contamination）（即一个近交系与非本品系动物之间杂交引起遗传改变）。由于遗传污染形成的亚系，通常与原品系之间遗传差异较大，因此对这样形成的亚系应重新命名。例如，由GLaxo保持的A近交系在发生遗传污染后，重新命名为A2G。

（2）亚系的命名　亚系的命名方法是在原品系的名称后加一道斜线，斜线后标明亚系的符号。亚系的符号可以是以下几种：

1）培育或产生亚系的单位或人的缩写英文名称，第一个字母用大写，以后的字母用小写。使用缩写英文名称应注意不要和已公布过的名称重复。例如，A/He，表示A近交系的Heston亚系；CBA/J，由美国杰克逊研究所保持的CBA近交系的亚系。

2）当一个保持者保持的一个近交系具有两个以上的亚系时，可在数字后再加保持者的缩写英文名称来表示亚系，如C57BL/6J、C57BL/10J分别表示由美国杰克逊研究所保持的C57BL近交系的两个亚系。

3）一个亚系在其他机构保种，形成了新的群体，在原亚系后加注机构缩写。如C3H/HeH是Heston（He）后加Hanwell（H）保存的亚系。

4）作为以上命名方法的例外情况是一些建立及命名较早，并为人们所熟知的近交系，亚系名称可用小写英文字母表示，如C57BR/cd等。但注意BALB/c、DBA/1、DBA/2不是亚系。