内生作用（endogenic process）主要是指由地球内部热能所导致矿物形成的各种地质作用，包括岩浆作用、火山作用、伟晶作用和热液作用等各种复杂的过程。
（1）岩浆作用（magmatism） 岩浆作用是指岩浆侵入到地下深处，随温度、压力的降低从熔体中依次结晶形成一系列矿物、岩石、矿产的作用。岩浆是形成于上地幔或地壳深处的、以硅酸盐为主要成分并富含挥发组分的高温（700～1300℃）、高压（5×10 8 ～20×10 8 Pa）的熔体。在地壳运动过程中，地下深处的岩浆在其挥发分及地质应力的作用下，沿深大断裂上侵，由于温度、压力的降低，首先从岩浆中结晶析出的是一些含量多、熔点高的矿物，而矿物的结晶析出必然会使岩浆各组分的相对浓度发生变化。随着温度、压力的缓慢降低及组分相对浓度的不断改变，相继析出颗粒较粗的各种矿物晶体。
在岩浆作用过程中，岩浆不断演化，先后析出的主要矿物——橄榄石、辉石、角闪石、黑云母、斜长石、正长石、微斜长石和石英等造岩矿物，形成各种矿物组合，构成不同的岩石类型，如超基性岩（SiO 2 含量小于45％）、基性岩（SiO 2 含量为45％～52％）、中性岩（SiO 2 含量为52％～65％）、酸性岩（SiO 2 含量为65％～75％）及碱性岩（富含K 2 O和Na 2 O）。此外，还可形成金刚石及铂族自然元素、铬铁矿、磁铁矿及Cu、Fe、Ni的硫化物等金属矿物，富集成极为重要的矿床与相应的岩浆岩共同产出。
（2）火山作用（volcanism） 火山作用实际上是岩浆作用的一种形式，是地下深处的岩浆沿地壳脆弱带上侵至地面或直接喷出地表，温度和压力快速降低条件下形成的一系列矿物、岩石的过程。
火山作用形成的矿物与相应岩浆岩中的矿物基本一致，所形成的岩石中超基性岩、基性岩、中性岩和碱性岩都有。但由于火山作用的特殊性，所形成的矿物和岩石有以下特点。
①火山岩中的矿物除斑晶外常呈隐晶质，矿物晶体肉眼不易识别。火山岩中还可以有一些在缓慢冷却条件下不稳定的矿物，如金刚石、方英石、透长石晶质（玻璃）存在。
②在火山通道（喷气孔）周围则常有经凝华作用形成的自然硫、雄黄、石盐等矿物产出。
③火山岩中由于挥发分逸出所造成的气孔，常被火山后期热液作用形成的一系列矿物（如沸石、蛋白石、玛瑙、方解石、自然铜等）所充填。
火山作用形成的矿产主要有自然硫、金刚石、铁、铜等。值得指出的是，在个别情况下，火山作用还可以喷溢矿浆，例如智利的拉科铁矿，就被认为是由溢出地表的铁矿浆结晶而成的。
（3）伟晶作用（pegmatitization） 伟晶作用是指在地表以下较深部位（3～8km）的高温（400～700℃）、高压（1×10 8 ～3×10 8 Pa）条件下所进行的形成一系列粗大矿物晶体及其伟晶岩的作用。
伟晶岩多呈脉状并成群产出，其主要矿物成分与相应的深成岩相似。伟晶作用中形成的矿物最明显的特点如下。
①伟晶岩的主要矿物成分仍以硅酸盐类矿物为主，如分布最广的花岗伟晶岩主要由长石、石英、白云母等矿物组成，但伟晶岩中的矿物结晶粗大，最大的长石晶体可达数吨。
②伟晶岩中有许多富含挥发分的矿物，如白云母、黄玉、电气石等，可形成白云母等非金属矿床。
③伟晶岩中稀有元素矿物显著富集，如绿柱石、锂辉石、磷灰石、独居石、锆石、铌铁矿、钽铁矿、褐帘石等，常可形成稀有元素、放射性元素的矿床。
（4）热液作用（hydrothermalism） 热液作用是指从气水溶液到热水溶液过程中形成矿物的作用。通常所说的热液是指富含各种金属元素、以H 2 O为主的挥发组分的岩浆期后热液（postmagmatic hydrothermal solution）。在岩浆演化的后期，由于外压减小，热液遂沿着围岩裂隙向上运移，并且从围岩中淋滤和溶解部分成矿物质，在适当的条件下，含矿热液便沉淀出各种矿物。
热液活动的深度范围从5～8km直至近地表，作用的温度为50～500℃。热液作用按温度大致分为高温、中温和低温三种类型。
①高温热液作用（high-temperature hydrothermalism） 温度为300～500℃。当温度高于374℃时热液呈气化状态，故又称为气水-高温热液作用。高温热液作用主要形成由W、Sn、Bi、Mo、Nb、Ta、Be、Fe等元素的高电价、小半径的阳离子组成的氧化物和含氧盐及部分硫化物，也常见含挥发分的矿物，如黑钨矿、锡石、辉铋矿、辉钼矿、铌钽铁矿等。
②中温热液作用（medium-temperature hydrothermalism） 温度一般为200～300℃。主要形成以Cu、Pb、Zn为主的硫化物和硫盐矿物，如黄铜矿、方铅矿、闪锌矿、黄铁矿和自然金等，一些分散元素（Ga、In、Tl、Ge、Se、Te等）则以类质同象的方式进入硫化物的晶格中。此外，还常见萤石、石英、重晶石及方解石等碳酸盐类矿物。
③低温热液作用（low-temperature hydrothermalism） 温度为50～200℃。低温热液的来源很复杂，大部分热液不一定直接来自岩浆，地下水热液和变质热液可能起了主要作用。主要形成As、Sb、Hg、Ag等的硫化物矿物组合，如雄黄、雌黄、辉锑矿、辰砂等。