1．平板菌落计数法
平板菌落计数法是实验室最常使用的活菌计数方法，将待测土样经过系列稀释至适宜的倍数后，土壤样品中的微生物被充分释放并形成单个细胞，然后吸取一定量的稀释液接种到无菌培养基上，待其混合均匀后，置于恒温培养箱中培养一定时间，在平板中可肉眼观察到各个单细胞微生物生长繁殖的菌落，计数培养基表面生成的菌落数便可计算出该土壤样品中的含菌数。一般以直径9cm培养基上出现30~300个菌落为宜。采用平板菌落计数法测得的菌落数是培养基上生长出来的菌落数，故也被称为活菌计数法。
2．4大类微生物菌落在平板中的形态特征及比较
每一类微生物在培养基上都有固定的菌落特征，微生物的个体菌落形态特征是以群体形态特征为基础的，微生物的群体形态特征则集中反映了个体形态特征。自然界中的大部分微生物菌落都可以根据菌落形态、菌落大小、可溶性色素的产生特征、透明程度、致密程度和边缘形状等来区分。
常见的4大类微生物菌落的基本特征如表6-1所示。
表6-1 细菌、放线菌、酵母菌和霉菌菌落的形态特征及主要区别