根系在土壤中的分布状态，因植物种类、生长发育状况、土壤条件等因素的不同而有差别。一般来说，具有发达主根的直根系，垂直向下生长，在土壤的深度达2~5m，甚至10m以上，常分布在较深土层，属于深根系；而须根系的主根不发达，侧根或不定根发达，并以水平方向朝四周扩展，多分布在土壤浅层，属于浅根系。其实，深根系和浅根系是相对的，根的深度在植物不同生育期是不同的，植物根系和地上部分具有一定的相关性，植物苗期的根均很浅，到成株后根系发达，入土深。
根系的分布往往受外界条件的影响，同一种植物，如果生长在雨水较少、地下水位较低，土壤排水和通气良好、土壤肥沃和光照充足的地方，其根系比较发达，入土较深。反之，根系入土较浅。人为的因素也能改变根系的深浅，如苗木的移栽、压条和扦插等易形成浅根系；种子繁殖、深层施肥能形成深根系。不同植物进行间作套种、绿化配置时，要考虑植物的根系在土层中的分布情况，将深根系和浅根系的植物互相搭配，使植物能吸收利用土壤中不同深度的养分和水分，充分发挥水肥的作用，使根系发育良好，有利于作物高产。